A mi me pasa igual
Mi bebé tiene tres meses y hace lo mismo que la tuya. Se chupa el puño cuando está nervioso o tiene hambre, y al final terminá con el pulgar metido en la boca. Se lo comenté a su pediatra y me dio estos consejos: intentar que coja el chupete, aunque a él no le gusta mucho, porque es más fácil quitar el hábito del chupe (se lo llevó un pajarito) que el del dedo (no le vas a cortar la mano al peque); si no quiere chupete, se le pone una manoplita con el pulgar cosido.
Como ya te digo que no quiere chupe, le pongo la manoplita y de momento está funcionando. Al principio, cuando se va a chupar la mano y se da cuenta de que la tiene puesta, se enfada un poco, pero luego deja de hacerlo y se le olvida. Bueno, espero haberte ayudado. Besos,
Ángeles