Son preguntas para un abogado, pero te doy mi opinión
Lo de la pensión, depende si vuestros hijos son independientes económicamente o no. Si todavía estudian y no traen dinero a casa, creo que sí has de pactar una pensión alimenticia hasta que se independicen. La cosa es de lógica aplastante, el dinero que os cuesten ahora vuestros hijos (comida, ropa, vivienda: hipoteca y recibos etc) habeis de calcular una cifra y dividirla entre los dos.
Lo de la segunda vivienda, yo te diría que igual que ella se queda el usofructo de la primera, tú te quedas con el de la segunda, lógico.
Lo de "propietarios", no es así, soy propietarios los dos de las dos (vamos si es así como lo teneis ahora) pero el usofructo de la primera es para ella y el de la segunda para ti. Si os separais amistosamente, no veo problema, diferente es como sea contencioso y llegueis a la disolución de bienes.... queda en manos de juez... chungo
Saludos